I januari 2004 mördas en kvinna brutalt i ett litet svenskt samhälle, och hennes granne förs till sjukhus med livshotande skador. Under de följande månaderna rullas ett osannolikt svartsjukedrama upp i medierna - det så kallade Knutbydramat - där otrohet vävs samman med maktbegär och en blind vilja till lydnad inför Gud. Knutbykoden bygger på en lång rad samtal som Eva Lundgren fört med den livstidsdömde pingstpastorn Helge Fossmo på Kumla-fängelset. Att Fossmo var en av de ansvariga för händelserna stod bortom alla tvivel, men i samtalen och under sitt arbete med rättsprotokoll och opublicerat material började Lundgren ana ett mönster, något som fattades i mediebilden och som måste blottläggas för att vi ska kunna förstå det som skedde i Knutby. Detta mönster kallar hon “Knutbykoden”.